Pela primeira vez, então, e por volta de 1720, visitou-as, nas suas vilas e povoados existentes, um Ouvidor de El-Rei - o ilustre Rafael Pires Pardinho, que andou a dar-lhes forma à vida e organização às mesmas, marcando os limites das respectivas jurisdições.
Foi justamente nessa oportunidade que Pardinho, em Provimento baixado a 29 de abril de 1720, na Câmara de São Francisco, fixou os seus limites com os de Paranaguá, definindo-os pelo Rio Guaratuba, desde a praia até os sertões.(5) Nota do Autor
Tinham os ouvidores de São Paulo jurisdição sobre todo o território catarinense, pois a sua alçada se estendia a todo o sul do Brasil e tal situação perdurou até 1723, quando, com a criação da Ouvidoria de Paranaguá, passaram as Vilas e póvoas de Santa Catarina a ser por ela jurisdicionadas, continuando, não obstante, sujeitas ao governo de São Paulo.
Em 1738, criando-se um governo militar na Ilha de Santa Catarina, governo que foi entregue ao insigne Brigadeiro José da Silva Pais, foi a Ilha separada do governo de São Paulo, bem como o Continente de São Pedro (Rio Grande do Sul) e anexada ao governo do Rio de Janeiro, providência logo seguida de outra, determinando o mesmo com relação à Laguna, território intermediário entre ambos.
Este governo militar instituído na Vila do Desterro é que viria a ser núcleo básico da formação de uma futura Capitania e, conseguintemente, da Província e do Estado de Santa Catarina.
Apesar dessas mudanças, a Justiça ainda era distribuída pela Ouvidoria de Paranaguá. E continuou a sê-lo,